本系應用統計系學碩士班研究生每學期至少修習三科目，最多15學分。

一、必修課程：統計理論(3)、企業倫理(1)。

二、必選課程：書報討論(一)(1/1)、書報討論(二)(1/1)。

三、選修課程：

1. 統計方法：實驗設計(3)、應用線性模式(3)、多變量分析(3)、類別資料分析(3)、抽樣理論(3)、函數型資料分析(3)、時間數列(3)、空間統計(3)、品質管制(3)、作業研究(3)、無母數迴歸(3)、分量迴歸(3)、貝氏分析專題(3)。統計方法課程須修畢9學分且成績及格。
2. 統計計算：統計計算(3)、統計計算與模擬(3)、機器學習(3)、深度學習(3)、分散式運算處理(3)、大數據進階軟體應用(3)。統計計算課程須修畢6學分且成績及格。
3. 統計應用：統計諮詢(3)、統計方法在臨床試驗上之應用(3)、資料探勘(3)、流行病學(3)、生物統計(3)、存活分析(3)、設限資料分析(3)、可靠度分析(3)、製程能力指標的理論與應用(3)、金融大數據(3)、人工智慧商務應用(3)、財務專題(3)、管理決策分析(3)、財金計量(3)、抽樣調查實務(3)、保險精算(3)、R在計量財務上的應用(3)、財務軟體應用(3)、健康資料應用軟體(3)、進階人工智慧在生物醫學上之應用(1)。統計應用課程須修畢9學分且成績及格。